כאמצעי סינון עמוק, פני השטח שלאלמנט קרום אוסמוזה הפוכהבהכרח יישארו קולואידים, מיקרואורגניזמים, חלקיקי טומאה ומלחים בלתי מסיסים על פני השטח שלו. לכן, לאחר שייכנסו לשימוש, בסופו של דבר יהיה צורך לנקות את מכשירי האוסמוזה ההפוכה המשמשים בתחומים רבים, אך משך מחזור הניקוי שונה. עם זאת, כאמצעי לניקוי ותחזוקה של מערכת אוסמוזה הפוכה, עיקור פגיעה והגנה קבועה,-ניקוי מקוון חסר אונים מול זיהום חמור של אלמנטים של קרום אוסמוזה הפוכה. בשלב זה, יש צורך לנקות את האלמנטים של קרום האוסמוזה ההפוכה-.
למרות שתהיה מידה מסוימת של מרווח בעיצוב שלמערכת אוסמוזה הפוכהלהבטיח שלא יהיה איום על ייצור בטוח עקב אספקת מים לא מספקת עקב הירידה בייצור המים או קצב ההתפלה של מערכת אוסמוזה הפוכה ועליית הלחץ ההפרש של מערכת אוסמוזה הפוכה במקרה חירום, אבל למעשה, זה הוא בגלל קיומם של השוליים האלה שלפעמים לא ניתן להציג תקלות נסתרות בזמן, מה שעלול בסופו של דבר להתפתח לזיהום חמור של רכיבי קרום אוסמוזה הפוכה.
הרעיון של זיהום חמור שלאלמנטים של קרום אוסמוזה הפוכההכוונה להידבקות פני השטח וזיהום השקיעה של ממברנת RO הנגרמים על ידי מוצקים מרחפים, קולואידים, אורגניים, מיקרואורגניזמים וחלקיקים אחרים הכלולים בהשפעה של מערכת אוסמוזה הפוכה, או היווצרות אבנית כימית לאחר שתוצר היונים גדול מתוצר המסיסות עקב תוצר המסיסות. לקיטוב ריכוז וגורמים אחרים על פני הממברנה. זיהום חמור מתייחס למצב שהפרש הלחץ בקטע בודד לאחר זיהום הוא יותר מפי 2 מהפרש הלחצים בקטע בודד בשלב ההתחלתי של פעולת המערכת, ייצור המים של מערכת אוסמוזה הפוכה יורד ביותר מ-30 אחוז, או המשקל של אלמנט ממברנת אוסמוזה הפוכה יחיד חורג מהערך הרגיל ביותר מ-3 ק"ג.
זיהום חמור הוא לעתים קרובות סופרפוזיציה של זיהום פיזי חמור וזיהום כימי חמור. במקרים מסוימים, הם מלווים בו זמנית.
